Митридат готовил Фарнака себе в наследники, но во время войны с римлянами Фарнак изменил своему отцу. Он боялся, что перенеся войну в Рим, по примеру Ганнибала, Митридат лишится царства, поэтому вступил в союз с Гнеем Помпеем10648 гг. до н.э. и стал готовить убийство отца. Митридат узнал о заговоре, но простил сына. В ответ Фарнак поднял восставше воинов — Митридат, чтобы не попасть в плен к римлянам, покончил с собой. Фарнак выдал римлянам тело отца. В Риме опасались, что Фарнак станет достойным преемником своего отца и решили оставить ему лишь Боспор с Херсонесом. Титул «друг и союзник римлян», который получил Фарнак , давался обычно вассальным по отношению к Риму государям. Фанагорию? римляне объявили автономным городом. Почти вся Малая Азия была обращена в римские провинции, лишь Каппадокия Каппадокия?ΚαππαδοκίαгречCappadociaлатИсторическая область в центре Малой Азии (на территории современной Турции); в древности район, известный как Великая Каппадокия.Смотреть полностью и Коммагена сохранили некоторую независимость, хотя также попали под контроль Рима.

Фарнак , не оставляя мечты о возвращении отцовских владений, и, воспользовавшись затруднениями римлян в западном Причерноморье и внутри самого Рима, он стал готовить войну со своими покровителями. Прежде всего войска Фарнака переправились через Понт Эвксинский и осадили, а затем подчинили себе Фанагорию, разгромив небольшие римские гарнизоны. После Понта настала очередь римской провинции Вифинии. Войска Фарнака перешли через Кавказ в Малую Азию и не только захватили часть бывших владений Митридата, но и создали угрозу крупнейшей из восточных провинций Рима — Азии.

Это вынудило армию во главе с Гаем Юлием Цезарем102(100)44 гг. до н.э., находившуюся в Египте, выйти навстречу Фарнаку в северо-западную часть Малой Азии. Здесь в 47 г. до н. э. в сражении у города Зелы войска Фарнака были наголову разбиты Цезарем, который отправил в сенат знаменитое послание: «Vene, vidi, vici» — «Пришел, увидел, победил».

Фарнак бежал к Синопу, а затем направился в Боспор. Однако здесь его ожидала неожиданность. Временно оставленный Фарнаком в качестве наместника Асандр объявил себя независимым правителем Боспора. Вступивший в борьбу за возвращение престола Фарнак был убит в одном из столкновений со своими противниками.